De acuerdo a los estatutos del Sindicato Único del Personal Académico de la Universidad Autónoma de Querétaro el Consejo Consultivo tiene las siguientes facultades:

Son facultades del Consejo Consultivo:

• Estudiar los asuntos que habrán de ser propuestos a la Asamblea General.
• Planear la estrategia adecuada para actualizar los acuerdos emanados de la Asamblea General.
• Planear y ejecutar resoluciones urgentes en aquellos casos en que sea materialmente imposible convocar y reunir a la Asamblea General, en cuyo caso persistirá la obligación de informar y ratificar dicho acuerdo ante la Asamblea General.
• Conocer y resolver en los conflictos inter-seccionales y, en general, en todos aquellos asuntos generales que requieran el consenso de todas las secciones sindicales.